疾病管制署2月13日自国内2月4日确诊首例H7N9境外移入个案检体成功分离病毒，并于2月15日完成全基因序列分析，相关序列讯息已于2月16日提供农委会并同步发布于国际GISAID网站与全球分享，并于2月20日经流感咨询委员会专家会议确认研判结果。结果显示，自个案检体分离出此境外移入H7N9流感病毒，其红血球凝集素（HA）与神经胺酸酶（NA）蛋白基因，与中国所分离出来的H7N9流感病毒相似，其他内部蛋白基因组合与目前病毒相比略为不同，可能为一个新的基因型，对禽类具高病原性，但无增强禽传人或人传人能力之突变。
个案已住院治疗
疾管署表示，自个案检体分离出的H7N9病毒在HA蛋白切割位新增3个碱性氨基酸，可能使其在禽类的病原性提高。此外，进一步的基因序列分析显示，该病毒的NA蛋白具有突变，对克流感及瑞乐沙等抗病毒药物具抗药性，专家推测可能是治疗过程筛选出来之抗药性病毒。疾管署于2月15日检出病毒抗药性时立即通知照护医疗团队作为治疗参考，目前个案仍病况严重住院治疗中。疾管署和农委会将密切掌握国际人类和禽鸟H7N9病毒流行株变化趋势，强化即时疫情监测及病毒监视，并于2月20日公布更新之新型A型流感临床诊疗指引，确保国人健康。
第一时间因发烧被拦检
针对外界近期对国内首例H7N9境外移入个案之防疫处置等疑义，疾管署重申，个案1月25日入境台湾，第一时间即因发烧被机场检疫人员拦检并开立就医敬告单建议就医，个案同日就医并于隔日转至某医学中心时医师即怀疑H7N9流感轻症，并立即通报采检，说明检疫站或医师均有高度警觉心及善尽监控通报责任，绝无延迟通报或误诊情形。
提高警觉 遵守“5要6不”原则
目前中国大陆仍处H7N9流感高峰期，民众如需前往请提高警觉，并应遵守“5要6不”原则，“5要”：禽肉及蛋要熟食、要以肥皂彻底洗手、出现症状要戴口罩速就医并告知职业及接触史、与禽鸟长期接触者要接种流感疫苗、要均衡饮食及适当运动；“6不”：不生食禽鸟蛋类或制品、不走私及购买来路不明禽鸟肉品、不接触或喂食候鸟及禽鸟、不野放及随意丢弃禽鸟、不将饲养禽鸟与其他禽畜混居、不去空气不流通或人潮拥挤的场所。
